A Universidade Federal de Uberlândia (UFU) foi fundada em 14 de Agosto de 1969, com a associação de diversas faculdades isoladas como a Faculdade de Engenharia, a Escola de Medicina etc. A federalização ocorreu em 24 de Maio de 1978 (Lei nº 6.532) quando também foi criado o Departamento de Ciências Exatas, que abrigava, entre outros, o corpo docente das áreas de Matemática e Estatística. Em 1981 foi criado o Departamento de Matemática, como integrante do Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia, que funcionou até o ano 2000. Com a implantação do Estatuto da UFU (Portaria Nº 682 do Ministro da Educação, de 26/04/1999), foram criadas as Unidades Acadêmicas, entre elas a Faculdade de Matemática e Física, que data de 05/01/2000 e durou poucos meses. A Resolução Nº 08/2000 do Conselho Universitário, de 27 de outubro de 2000, criou a Faculdade de Matemática (FAMAT). Desde sua criação, a FAMAT aumentou significativamente seu número de docentes e técnicos administrativos em educação, e sua atuação no ensino, sendo responsável por disciplinas de vários cursos de graduação e pós-graduação, na pesquisa e  extensão, se tornando uma das maiores unidades acadêmicas da UFU. Em 2024, a Resolução Nº 76 do Conselho Universitário, de 25 de março de 2024, criou o Instituto de Matemática e Estatística (IME), que desde então funciona de acordo com o Estatuto e o Regimento Geral da UFU e seu Regimento Interno. Atualmente, o IME possui três cursos de graduação (dois presenciais e um à distância), um curso de mestrado acadêmico e dois cursos de mestrado profissional, sendo um deles em rede nacional e outro na modalidade de consórcio com outras três Unidades Acadêmicas da UFU. Além disso, o IME responde por todas as atividades ensino, nas áreas de Matemática e Estatística, junto aos cursos de graduação da UFU com sede nos quatro campi de Uberlândia e nos campi de Monte Carmelo e Patos de Minas.